THÔNG TIN TỪ NGÂN HÀNG GEN QUỐC TẾ GIỐNG NẾP NGỰ BÌNH ĐỊNH     (GenBank: OR880900.1-OR880901.1)

Do GSTS :Nguyễn thị Lang,Thạc sĩ Nguyễn thị Khánh Trân  

 Viện Nghiên Cứu Nông Nghiệp Công Nghệ Cao ĐBSCL  đã giải mã DNA và thành công   mẫu  hai giống  DNA của đã chấp nhận của Ngân hàng gen Quốc Tế (NCBI)   NGÀY 18 THÁNG 12 NĂM 2023.

Đăng ký ngân hàng gen chuỗi mã GenBank: OR880900.1-OR880901.1

Nếp Ngự là một loại nếp địa phương tại Bình Định Miền Trung của Việt Nam . Ở Bình Định ,  lúa nếp Ngự được trồng lúa ngập nước hoặc vùng cao, ở vùng đất thấp và cao nguyên, với số lượng nhỏ cùng với  các giống lúa cao sản khác. Nghiên cứu này đã kiểm tra sự đa dạng của 100  dòng lúa nếp được thu thập từ nông dân  và được đánh dấu của SSR và SNP để tìm và  phân biệt phân loài,  Có 2  dòng 52 và dòng 81 được chọn lọc và đánh giá các đặc điểm chất lượng hạt được chọn, cụ thể là mùi thơm và các tính trạng kháng sâu bệnh , khi được trồng cùng nhau như lúa đất ngập nước. Việc xác định các quần thể lúa  nếp Ngự với  mùi thơm  đặc biệt chứng minh rằng các giống lúa  nếp Ngự có thể là một nguồn đặc điểm hữu ích về mặt nông học, đồng thời là một di sản văn hóa quan trọng và góp phần vào sự đa dạng di truyền của  nguồn gen lúa địa phương.Viện Nghiên cứu Nông nghiệp  công nghệ cao ĐBSCL , Việt Nam đã Giải mã trình tự DNA  của hai dòng dòng số 52  với mã trình tự là OR880900.1  và dòng số 81 với mã trình tự đăng ký ngân hàng gen là  OR880901.1

Mã trình tự  linked

Mã trình tự của dòng nếp Ngự 52 là OR880900.1

ORIGIN     

        1 ctgtgggcat tcatcacgaa cgcatccgaa aaaaaactac gtatatagag tatatatcag

       61 gaaaatgttc tatatacatg taaatatact aagcaataat atccacctgg actatccaaa

      121 cttgaaaata ttcacaggag aaaaacaaaa atgatctagc ataaaatata aggaaagaag

      181 aaaagagcga gagggttttt acagagacag agagtcgtat aatacactta ctgctgtacc

      241 tagctgctgc cgtgctgtgc caaatatagc ctgcattgtt aaattaggga tatatataag

      301 aactaccttt gaaccctagc aagcacatgc tgaattattt ccacaaacca aaacagaaat

      361 ctgccgcatt tcacgtgtaa aatatttcag tgtgcatctc tagaagaaac aaaaccgaga

      421 agcaaaatca agagcgagca tgacagcatg acacaggccc tcttaaacca attttgtatc

      481 gaaagtaaat tcccagtaaa tgcaacctaa cagaatttaa acaggatggc aaacacacaa

      541 tacaaatacg ggtggatgca gcggatccac ctggactatc caaattggct gtcggggcca

      601 gatcacgctg tgcgctgggc cccaccgcca aaacaccacg caccaaacac gacccactaa

      661 aactacgaaa agagagagag agagaagaga gccccctagc gagctcgcgc gaatgcgaag

      721 aaatcccgcc acgtgtgccc accccggtgg gacccacctc tatatagctt tatatacggc

      781 tcatcacgaa cgcatccgaa gtatatagag agagagagag aagagagttt gtgcccaccc

      841 tgtagcgagc tcgcgcgaat gcgaagccaa ccgagagagg tctcgatacc aaatccctgg

      901 cacccaccat ataattgtta ttataatttg atggtttaaa gagatattta

 

Mà trình tự  của dòng nếp Ngự 81 của Bình Định OR880901.1

ORIGIN     

        1 ctgtctccat tatttttcag gaaaatgttc ttttttcatg taaatatact aagcaataat

       61 cttgaaaata ttcacaggag gggaacaaaa atgatctagc ataatttata aggaaagaag

      121 aaaagagcga gagggttttt acagagacag agagtcgtat aatacactta ctgctgtatt

      181 caaatatagc ctgcattgtt aaattaggga ttaggttctg aagccggtgc tatatatata

      241 aactacctgg gaaccctagc aagcacatgc tgaattattt ccactggcca aaacagaaat

      301 ctgccgcatt tcacgtgtaa tagaagaaac aaaaccgaga agcaaaatca agagcgagca

      361 tgacagcatg acacaggccc tcttaaacca attttgtatc gaaagtaaat tcccagtaaa

      421 tgcaacctaa cagaatttaa acaggatggc aaacacaccc catatcctac tatagctcaa

      481 actatatacg ggtggatgca gcggatccac ctggactatc caaattggct gtcggggcca

      541 gatcacgctg tgcgctgggc cccaccgcca acacaccacg caccaaacac gacccactaa

      601 aactacgaaa agagagagag agagttgaga gttggttagc gagctcgcgc gaatgcgaag

      661 aaatcccgcc acgtgtgccc accccggtgg gacccacctc ggtcccgctt tatatacggc

      721 tcatcacgaa cgcatccgtt gtatatagag agagagagag aagagagttt gtgcccaccc

      781 tgtagcgagc tcgcgcgaat gcgaagccaa ccgagagagg tctcgatacc aaatccctaa

      841 gccccaccat ataattgtta gtataatttg atcctttaaa gagatatata